標題摘要內容
RNA sequencing
小RNA測序
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2017-09-02 | 4425 次瀏覽 | 分享到:

RNA是指一類高度保守的長度為18-32ntRNA分子,主要包括miRNA、siRNA、snoRNApiRNA等,是生命活動重要的調控因子,在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用。研究表明, 包括癌癥、心血管疾病、免疫系統疾病在內的多種疾病與miRNA 的調控作用密切相關。近年來, 由于小RNA測序技術的應用,越來越多的miRNA被發現和功能鑒定,并將廣泛應用于疾病診斷、個性化治療和預后等領域。

 

技術路線

 

樣品要求


樣品類型:細胞、新鮮組織、FFPE組織、血液RNA、血清血漿RNA外泌體RNA樣品等。

物種:人、大小鼠(特殊物種詳詢技術支持)

?具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄一。

 

測序方案

測序模式 PE150

測序數據量 10M reads


生物信息分析內容

1 miRNA測序分析

2 原始數據質控檢查;

3 比對結果質控檢查

4 miRNA預測

5 ncRNA注釋(rRNA / tRNA / snRNA / snoRNA /piRNA

6 基于miRNA表達的樣品主成分分析

7 miRNA差異分析

8 差異miRNA靶基因GO功能分析

9 差異miRNA靶基因通路分析

10 差異miRNA與差異表達基因調控分析(如果有mRNA測序結果)

11 差異miRNA與差異表達基因網絡繪圖(如果有mRNA測序結果)



高通量測序附錄

高通量測序?